Биомаркеры
Тестирование биомаркеров может помочь в поиске дополнительных индивидуальных вариантов лечения, включая участие в клинических исследованиях.
Если вам поставили диагноз рак, важно, чтобы вы и ваш врач получили как можно больше информации о вашей опухоли. Понимание биомаркеров опухоли поможет вам обоим принять важные решения о вашем лечении.
Ваше тело состоит из клеток разного вида. Каждую клетку можно представить как маленькую "фабрику", которая производит всевозможные молекулы, обеспечивающие бесперебойную работу фабрики. Каждый вид клетки производит уникальный набор молекул, называемый молекулярный "портрет" ("подпись"). Этот "портрет" помогает идентифицировать каждую клетку и ее действия.
Биомаркер - это любая молекула, которую можно измерить в опухолевой ткани, крови и других жидкостях организма.
Термин "биомаркер" является сокращением от "биологического маркера". Биомаркеры позволяют врачам отслеживать работает ли человеческий организм нормально или есть признаки заболеваний или других состояний.
Когда вы сдаете обычный анализ крови, в отчете лаборатории перечислены различные биомаркеры, такие как уровень гормонов щитовидной железы, уровень глюкозы, а также уровень эритроцитов и лейкоцитов. Они помогают вашему врачу увидеть, как работает ваш организм или как вы реагируете на лекарство.
Злокачественные клетки когда-то были нормальными здоровыми клетками. Поломки в генах нарушили их. Поломанные клетки быстро делятся, образуя опухоль, которая вытесняет здоровые клетки. Поломки могут происходить разными способами. Если мы посмотрим на опухолевые клетки трех разных людей с одним и тем же видом онкологии, то есть вероятность, что мы обнаружим разные молекулы, которые управляют каждой из этих опухолей.
Термин "биомаркеры рака" обозначает молекулы, которые производятся либо опухолевыми клетками, либо другими клетками организма в ответ на опухоль. Они также могут называться "маркеры опухоли" или "драйверные (ведущие) мутации".
Биомаркеры рака могут быть разных видов, включая генные мутации. Внутри каждой из ваших клеток есть ДНК, содержащая тысячи генов. Каждый ген несет в себе информацию о том, как построить специфический определенный белок, чтобы помочь функционированию клетки. Если какая-нибудь инструкция для строительства белка нарушается, полученный белок будет дефектным. В этом случае говорят, что поломанные гены "мутировали". Мутации могут передаваться по наследству или приобретаться.
- Унаследованные мутации присутствуют во всех ваших клетках. Они передаются из поколения в поколение и могут повлиять на риск заболеть некоторыми видами рака. Тестирование на наследственные мутации называется "генетическим тестированием". Это делается главным образом для оценки риска у тех, кто не болен раком.
- Приобретенные мутации присутствуют только в опухолевых клетках и выявляются путем тестирования биомаркеров. Понимание этих биомаркеров помогает при принятии решения в лечении.
- Белки производятся как здоровыми, так и злокачественными клетками. Но злокачественные клетки часто производят слишком много белка или аномальный белок. Это можно выяснить в результате тестирования биомаркеров.
Биомаркеры рака бывают диагностические, прогностические и предиктивные. Все они могут дать важные подсказки при выборе правильного курса в лечении.
- ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ биомаркеры могут дать понимание вам и вашему врачу, есть ли у вас рак и помочь определить вид рака (напр., онкомаркеры, биохимические показатели крови и т.д.).
- ПРОГНОСТИЧЕСКИЕ биомаркеры помогают определить вероятность рецидива или прогрессирования рака. Они также могут спрогнозировать, как вы будете себя чувствовать с лечением и без лечения (напр., BRAF, FGFR, HER2, IDH1-2 и т.д.).
- ПРЕДИКТИВНЫЕ биомаркеры могут помочь найти, какие виды лечения вероятно будут эффективны против вашей опухоли, а какие - нет (напр., BRAF, FGFR, HER2, IDH1, NTRK, MSI-H, PD-L1, TMB-High и т.д.). Эти виды лечения могут быть:
>> утверждены для вашего вида рака,
>> утверждены для другого вида рака, но они изучаются в клинических исследованиях, чтобы понять эффективность при вашем виде рака,
>> на стадии разработки и изучаются в клинических исследованиях.
Исследователи обнаружили, что разные виды рака связаны с определенным своим набором биомаркеров. Как правило, не все пациенты с одним и тем же видом рака имеют одинаковые биомаркеры.
Понимание того, какие биомаркеры влияют на вашу конкретную опухоль, может помочь вам и вашему врачу выбрать наилучший способ лечения рака именно для вас. Это также может открыть двери к более новым лекарствам и клиническим исследованиям, которые доступны только пациентам с определенными биомаркерами.
Тестирование биомаркеров особенно важно для людей с редкими видами рака и видами рака, у которых мало вариантов лечения. Биомаркеры при разных видах рака могут быть схожими. Если у вас редкий вид рака с мутацией, которая наблюдается при других видах рака, возможно, существует лечение, которое потенциально может сработать и при вашем виде рака.
Проводятся клинические исследования, изучающие потенциальный эффект лечения у пациентов с разными видами рака, имеющими один и тот же биомаркер.
Вот почему так важны ваши биомаркеры!
Биомаркеры, вызывающие у вас рак, могут определить предлагаемое вам лечение.
- Таргетная терапия
В зависимости от того, какие мутации вызывают у вас рак, вам может быть показана утвержденная таргетная терапия, которая направлена против злокачественных клеток с определенной мутацией, при этом минимизируется вред здоровым клеткам.
Вы также можете стать кандидатом для участия в клинических исследованиях таргетной терапии, которая находится на стадии разработки или утвержденная для другого вида онкологии.
- Иммунотерапия
Иммунотерапия использует силы вашей собственной иммунной системы для борьбы с раком.
Наличие любого из следующих биомаркеров является поводом для применения иммунотерапии:
>> MSI-H / dMMR
>> PD-L1
>> TMB-High
Более подробно об этих биомаркерах читайте в разделе Лечение (иммунотерапия).
Тестирование биомаркеров поможет узнать биомаркеры опухоли. На практике тестирование биомаркеров могут еще называть:
- геномное тестирование / профилирование
- тестирование / профилирование опухоли
- молекулярное (молекулярно-генетическое) тестирование / профилирование
Существует много различных тестов на биомаркеры, которые проверяют конкретный биомаркер. Чтобы получить полное представление о мутациях и белках, которые возможно питают опухоль, лучше сделать комплексное тестирование.
Не путайте геномное тестирование с генетическим тестированием.
Геномное тестирование проверяет опухолевые клетки на наличие биомаркеров.
Генетическое тестирование проводится с использованием образца крови, мочи, слюны, волос, околоплодных вод или другой жидкости организма для проверки унаследованных от родителей мутаций, которые могут повысить риск развития определенных видов рака.
Для тестирования биомаркеров необходим образец опухоли - кусочек ткани, забираемый обычно во время биопсии. Ткань опухоли также доступна после хирургической операции.
Если вам предстоит биопсия, попросите врача забрать достаточно ткани для тестирования биомаркеров. Затем ткань опухоли отправляется в лабораторию, чтобы выяснить какие биомаркеры могут быть причиной рака.
Комплексное тестирование выявляет как биомаркеры, против которых есть таргетная терапия, так и биомаркеры, против которых может еще не быть терапии вообще. Таким образом, если в будущем станет доступно новое лечение против выявленного у вас биомаркера, вы можете стать кандидатом для этой новой терапии.
Обязательно сохраните у себя копии отчетов о тестировании биомаркеров.
В идеале тестирование биомаркеров необходимо проводить сразу, как поставлен диагноз "рак", чтобы вы и ваш врач знали о всех вариантах возможного лечения.
Если вам собираются проводить биопсию потому, что подозревают рак:
- предупредите врачей, что вы заинтересованы сделать тестирование биомаркеров и попросите забрать достаточно ткани.
Если вам уже провели биопсию:
- уточните, тестировали ли образец ткани вашей опухоли на биомаркеры.
>> если нет:
>>> узнайте, можно ли провести тестирование биомаркеров с использованием имеющегося образца ткани опухоли; тогда вам не надо будет проводить повторную биопсию.
>> если да:
>>> узнайте, можете ли вы быть кандидатом на таргетную терапию, иммунотерапию или для клинических исследований. Также обязательно попросите копию отчета!
Со временем, если терапия перестанет действовать и рак рецидивирует, это может означать, что злокачественные клетки эволюционировали и развились новые мутации. В этом случае попросите вашего врача о необходимости проведения повторной биопсии и повторного тестирования биомаркеров. Повторное тестирование биомаркеров может выявить новые биомаркеры, на которые есть шанс воздействовать.
Качество и точность тестирования биомаркеров зависят от:
- квалификации специалистов, выполняющих тестирование,
- качества реактивов, используемых при тестировании,
- применяемого метода тестирования (ПЦР или секвенирование нового поколения). На это может влиять оснащение лаборатории оборудованием.
На сегодня лидерами в России являются:
- Научная лаборатория молекулярной онкологии НМИЦ онкологии имени Н.Н. Петрова, которая является частью научного отдела биологии опухолевого роста данного центра.
-
Отдел молекулярных технологий, НИИ трансляционной медицины,
ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" Минздрава РФ. Руководитель - Зарецкий Андрей Ростиславович Контакты: 117997, Москва, ул. Островитянова, 1 стр. 9 Тел: 8 (916) 815-95-56 E-mail: a-zaretsky@yandex.ru
Мировыми лидерами, выполняющими комплексное геномное профилирование с самой широкой панелью генов являются:
На сегодня панель, выполняемая Отделом молекулярных технологий, НИИ трансляционной медицины, ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" Минздрава РФ в рамках комплексного геномного профилирования, не уступает мировым лидерам.
Биомаркеры можно тестировать на индивидуальной (штучной) основе и комплексно смотреть широкую панель биомаркеров.
При штучном подходе придерживаются следующих подходов:
- исключающий
Он основан на том, что при определенных биомаркерах есть высокая вероятность отсутствия других. Например, мутация KRAS, как правило, исключает наличие других драйверных (ведущих) мутаций. Таким образом, если вы тестируете KRAS и находите его, то есть большая вероятность отсутствия каких-либо других драйверных (ведущих) мутаций и проводить дальнейший поиск мутаций смысла нет.
- последовательный
Сначала ищете одни биомаркеры, не нашли - еще другие биомаркеры, потом еще и т.д.
Вы должны четко понимать, что каждый такой заход на тестирование биомаркеров - это каждый раз:
>> время!
>> расход ткани опухоли в парафиновом блоке!
>> деньги!
Как правило при агрессивном течении рака у пациента нет времени. А если проводилась только биопсия (не хирургическая операция) количество ткани опухоли в образце-парафиновом блоке тоже ограничено.
В рамках комплексного тестирования с использованием эффективных современных технологий можно получить по малому количеству материала максимум информации за достаточно короткий промежуток времени!
При планировании проведения тестирования биомаркеров вам необходимо максимально детально обсудить это с врачами и возможно даже с биологами опухоли (молекулярными онкологами), чтобы оценить какой подход будет наиболее разумным в вашем конкретном случае.
Для молекулярного профилирования образец ткани, взятый из опухоли (биопсия опухоли), идеально подходит для подтверждения и получения информации о злокачественных клетках опухоли.
Иногда биопсия невозможна из-за размера или расположения опухоли.
Другой возможный вариант - жидкостная биопсия заключается в тестировании молекул или целых клеток, которые опухоль выделяет в кровь, мочу и другие жидкости организма.
Жидкостная биопсия может использоваться для тестирования молекулярных особенностей рака также как и биопсия ткани опухоли.
Еще одна опция использования жидкостной биопсии - для контроля динамики лечения или возникновения рецидива:
- уровень циркулирующей опухолевой ДНК увеличивается с прогрессированием заболевания и снижается после успешного терапевтического и
хирургического лечения, что позволяет применять данный метод для мониторинга опухолевого ответа на терапию,
- в случае подозрения на рецидив есть опция проверить появление вновь циркулирующей опухолевой ДНК, обнаруженной ранее, или
- осуществить поиск новых мутаций в циркулирующей опухолевой ДНК, возникающих с течением времени в процессе терапии, и вызывающих терапевтическую резистентность опухоли.
Ограничения жидкостной биопсии:
❌ Анализ лучше не делать на фоне проводимой химиотерапии, поскольку химия может уменьшить количество циркулирующих опухолевых клеток в крови и, следовательно, шансы обнаружить мишени.
Поэтому надо подобрать «окно» для анализа - как минимум 2 недели после последнего приёма/вливания хт препаратов, забрать кровь и продолжить лечение по графику.
❌ Не каждая опухоль выбрасывает злокачественные клетки в кровь.
При одном и том же виде рака и стадии у одного пациента опухоль будет выбрасывать злокачественные клетки в кровь, у другого - может не выбрасывать. Поэтому не обнаружение мишеней по крови не означает их отсутствие в ткани опухоли. Однако, если обнаружено в крови, значит в ткани опухоли точно есть.
Комплексное геномное профилирование можно по крови заказать в Foundation Medicine. Анализ называется FoundationOne®LiquidCDx.
Анализ индивидуальной мишени по крови можно сделать в Отделе молекулярных технологий, НИИ трансляционной медицины, ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" МЗ РФ. Руководитель - Зарецкий Андрей Ростиславович Контакты: 117997, Москва, ул. Островитянова, 1 стр. 9 Тел: 8 (916) 815-95-56 E-mail: a-zaretsky@yandex.ru. Аналогично у них тоже может быть выполнено комплексное геномное профилирование по крови той же панели, что и по ткани.
О своем опыте использования жидкостной биопсии (кровь) я писала тут.
Мы уже обсудили, что для молекулярного профилирования образец ткани, взятый из опухоли, идеально подходит для подтверждения и получения информации о злокачественных клетках опухоли. Иногда биопсия невозможна из-за размера или расположения опухоли.
Другой возможный вариант - жидкостная биопсия заключается в тестировании молекул или целых клеток, которые опухоль выделяет в кровь, мочу и другие жидкости организма. Жидкостная биопсия может использоваться для тестирования молекулярных особенностей рака также как и биопсия ткани опухоли. Еще одна опция использования жидкостной биопсии - для контроля динамики (рецидива).
Исследования показывают, что жидкости организма, находящиеся близко к местам метастазирования, например, асцитная жидкость могут превосходить кровь по информативности для поиска мишеней.
Нередко пациенты с прогрессированием не имеют возможности провести новый забор ткани опухоли, при этом накапливается и периодически откачивается асцитная жидкость.
Асцитная жидкость может быть использована для поиска индивидуальной мишени, выполнения комплексного геномного профилирования или отслеживания динамики (рецидива).
Для целей анализа асцитную жидкость необходимо нанести на цитологическое стекло, не гистологическое!
По всем вопросам обращаться в Отдел молекулярных технологий, НИИ трансляционной медицины, ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" Минздрава РФ. Руководитель - Зарецкий Андрей Ростиславович Контакты: 117997, Москва, ул. Островитянова, 1 стр. 9 Тел: 8 (916) 815-95-56 E-mail: a-zaretsky@yandex.ru.
Пациенты с холангиокарциномой имеют мало вариантов лечения и печальный прогноз при стандартных вариантах системной химиотерапии.
Однако результаты комплексного геномного профилирования показывают, что более 50% пациентов с холангиокарциномой, особенно внутрипеченочной холангиокарциномой, имеют по крайней мере одну мишень, на которую можно пытаться воздействовать.
Этот факт дает дополнительные персонализированные варианты лечения, включая возможность участия в клинических исследованиях, которые являются шансом побороться с данным диагнозом.
Известные мишени при холангиокарциноме: APC, ARID1A, ATM, BAP1, BRAF, BRCA2, CCND1, CDKN2A, CDKN2B, ERBB2, FGFR2, FRS2, IDH1, IDH2, KRAS, MCL1, MDM2, MSI (микросателлитная нестабильность), MYC, NRAS, PBRM1, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11, TP53 и другие. Известно порядка 25 мишеней, связанных с холангиокарциномой. Причем часть из них встречаются как при холангиокарциноме, так и при других видах рака.
Чаще всего встречаются KRAS и TP53, к которым по-прежнему нет препаратов, есть только разработки и попытки воздействовать в рамках клинических исследований.
Мишени, к которым есть препараты и на которые можно пытаться воздействовать, включают:
- IDH1-2 мутации
- FGFR слияния и мутации
- HER2 (ERBB2) амплификация и мутации
- BRAF мутации
- PIK3CA мутации
- NTRK
- MSI (микросателлитная нестабильность)
- EGFR
- ALK
- ROS1
- MEK
- RET
- BRCA1-2
Микросателлитная нестабильность, мутационная нагрузка опухоли и статус PD-L1 могут говорить о возможной эффективности иммунотерапии.
Около 3% пациентов с холангиокарциномой имеют микросателлитную нестабильность и имеют положительный долгосрочный эффект с ингибиторами контрольных точек иммунного ответа.
Обнаружение персонализированных мишеней при холангиокарциноме, на которые можно эффективно воздействовать, вызвало огромный научный исследовательский и фармацевтический интерес к данному заболеванию. На сегодня в мире несколько сотен клинических исследований, в которых пациенты с холангиокарциномой имеют право участвовать.
Своевременное геномное профилирование пациентов с холангиокарциномой имеет решающее значение!
Тестирование биомаркеров сразу после постановки диагноза в случае местнораспространенного или метастатического заболевания дает пациентам шанс получить от тестирования пользу в лечении.
Мы призываем к проведению тестирования биомаркеров у всех пациентов с холангиокарциномой как можно раньше.
Часто бывает достаточно ткани, забранной во время биопсии для целей постановки диагноза. Учитывайте необходимость молекулярного профилирования при холангиокарциноме и используйте забор ткани толстой иглой вместо тонкой во время биопсии для целей постановки диагноза, чтобы забрать достаточное количество ткани и избежать повторной биопсии.
В некоторых случаях рецидив или распространение рака могут привести к возникновению новых активирующих (драйверных) мишеней, поэтому следует рассмотреть возможность повторной биопсии для целей повторного геномного профилирования при рецидиве.
Читайте также статью о молекулярно направленном лечении при билиарном раке.
Статистику мишеней можно также посмотреть на CBIOPORTAL.ORG, где крупнейшие онкологические центры аккумулируют свои исследования результатов молекулярного профилирования.
Назначения в лечении по результатам молекулярного профилирования опухоли делает врач.
Но есть ещё один специалист, с которым вам обязательно стоит пообщаться. Это - биолог опухоли. Человек, который понимает
- индивидуальные особенности опухоли,
- мишени для таргетной и иммунотерапии,
- какую чувствительность и к каким препаратам можно ожидать конкретно у вашей опухоли,
- какие есть разработки в клинических исследованиях или экспериментальном лечении для обнаруженных мишеней.
С биологом опухоли точно стоит обсудить результаты молекулярного профилирования.
Проконсультироваться стоит также когда
- вы решаете, какой объём тестирования разумно выбрать именно в вашем случае. Широкую панель или поштучно, а если поштучно, то какие именно мишени.
- по результатам предыдущего тестирования не нашли поломок, чтобы выбрать дальнейшую стратегию поиска.
Один из таких специалистов - Зарецкий Андрей Ростиславович, молекулярный онколог, не врач, но именно биолог опухоли. Один из сильнейших в России. Руководитель Отдела молекулярных технологий, НИИ трансляционной медицины ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" Минздрава РФ (117997, Москва, ул. Островитянова, 1 стр. 9).
Андрей Ростиславович открыт для общения с онкологическими пациентами и их близкими.
Вы можете направить документы на электронную почту a-zaretsky@yandex.ru
Правила и пожелания к коммуникации:
- по возможности пишем всё по электронной почте;
- к электронным письмам прикрепляем максимум медицинских документов;
- медицинские документы присылаем в читаемом виде (лучше в виде одного многостраничного pdf, страницы располагаем в правильном порядке,
сканы делаем с нормальным разрешением и в правильной позиции - не сбоку и не вверх ногами); - четко формулируем имеющиеся вопросы;
- ждем - ответ будет при первой возможности, но это иногда полчаса с момента получения письма, а иногда две недели;
- принимаем предлагаемые вам пути дальнейшего общения (нужно приехать / не нужно приезжать / нужно созвониться / и т.д.) или прекращаем общение.
Тестирование биомаркеров, к сожалению, довольно недешево.
Тем не менее определенные биомаркеры можно проверить по ОМС с использованием формы 057.
Ситуация по объему тестирования, входящему в программу ОМС, отличается в разных регионах.
Уточнить какие именно биомаркеры входят в программу ОМС в вашем регионе вы можете, если загляните в тарифы на оплату медицинской помощи, оказываемой в амбулаторных условиях в рамках Территориальной программы ОМС, которые являются частью Тарифного соглашения. Найти Тарифное соглашение на текущий год можно на сайте вашего Территориального фонда ОМС.
Вы также можете попробовать уточнить по телефонам горячей линии вашей страховой компании и Территориального фонда ОМС.
Перечень Территориальных фондов ОМС по регионам здесь.
Тестирование биомаркеров по ОМС в 2020 году - Москва
Тестирование биомаркеров по ОМС в 2020 году - Республика Татарстан
Тестирование биомаркеров по направлению формы 057 можно выполнить в молекулярно-биологической лаборатории Московской Городской Онкологической Больницы №62, в том числе с направлением из регионов. При согласовании со специалистами лаборатории по телефону можно направить все материалы с курьерской службой.
Также житель любого региона РФ может выполнить тестирование биомаркеров по направлению формы 057 в лаборатории молекулярной онкологии НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова.
Ряд тестирований биомаркеров можно сделать бесплатно в рамках Национальной программы Российского общества клинической онкологии "Совершенствование молекулярно-генетической диагностики в РФ с целью повышения эффективности противоопухолевого лечения".
На сегодня в программу попадают пациенты с
- раком легкого,
- раком молочной железы,
- колоректальным раком,
- раком яичников,
- меланомой,
- уротелиальным раком,
- раком предстательной железы.
К сожалению, программа пока не распространяется на тестирование биомаркеров при билиарном раке.
Видео: Медицинское Маркетинговое Агентство
"Мы движемся от стандартных вариантов химиотерапии для широкого спектра злокачественных новообразований к более направленному лечению - таргетной терапии и очевидной максимальной персонализации лечения"
Бредер Валерий Владимирович, д.м.н., ведущий научный сотрудник ФГБУ "НМИЦ онкологии им. Н. Н. Блохина"
Видео: Cholangiocarcinoma Foundation
ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" Минздрава РФ
КОНТАКТЫ:
ФГАОУ ВО "РНИМУ им. Н. И. Пирогова" МЗ РФ
117997, Москва, ул. Островитянова, 1 стр. 9
Тел: 7 (916) 815-95-56
E-mail: a-zaretsky@yandex.ru
Геномное профилирование
Комплексное геномное профилирование
Комплексное геномное профилирование